Embora o Teste Pré-Natal Não Invasivo (NIPT) tenha revolucionado o diagnóstico pré-natal, permitindo a detecção de diversos problemas genéticos no feto, ele ainda apresenta limitações e, portanto, não identifica muitas causas genéticas de anomalias. Uma nova técnica, apresentada no dia 13 de junho na conferência anual da Sociedade Europeia de Genética Humana, introduz uma tecnologia chamada Sequenciamento Fetal Não Invasivo (NIFS), que rastreará simultaneamente quase 23.000 genes, bem como todas as condições atualmente detectadas pelo NIPT, em gestações com e sem anomalia fetal previamente diagnosticada. Ao apresentar a pesquisa, o Dr. Christopher Whelan, cientista computacional sênior que trabalha no laboratório do Dr. Michael Talkowski no Broad Institute do Instituto de Tecnologia de Massachusetts e Harvard, e no Centro de Medicina Genômica do Hospital Geral de Massachusetts, em Boston, EUA, afirma que a nova técnica foi capaz de identificar uma proporção muito alta de variantes genéticas clinicamente relevantes que atualmente só são detectáveis por sequenciamento genômico invasivo (GS). “A descoberta sugere que o NIFS pode ser usado como uma ferramenta de triagem mais segura e igualmente precisa em todas as gestações”, afirma ele. 

A maioria dos métodos NIPT atuais tem baixa resolução e se concentra apenas em um pequeno número de anormalidades genéticas, e há pouca padronização entre eles. O teste abrangente de todos os genes relevantes para o diagnóstico pré-natal só é acessível por meio de métodos de testes invasivos. Atualmente, muitas mulheres recusam os métodos de sequenciamento invasivos — amniocentese e biópsia de vilo corial (BVC) — devido ao risco para o feto, ao estresse relacionado, às dificuldades de acesso e ao custo, embora sua capacidade diagnóstica seja alta. “Estávamos tentando desenvolver um teste com valor diagnóstico semelhante, mas sem os riscos e outras desvantagens”, comenta Dr. Christopher Whelan. 

Os pesquisadores testaram o NIFS em 565 gestações com uma média de 17 semanas de gravidez. Eles aplicaram o sequenciamento profundo de DNA fetal livre de células (cffDNA) à análise de amostras de sangue materno e usaram métodos computacionais avançados para identificar variantes genéticas em quase 23.000 genes (o exoma) em cada feto. A comparação de suas descobertas com as do sequenciamento direto do feto após amniocentese ou biópsia de vilo corial (CVS) permitiu verificar sua precisão; eles descobriram que o NIFS detectou cerca de 95 a 99% das variantes genéticas encontradas pelos métodos invasivos, dependendo do tipo de variante e do padrão de herança e, principalmente, 97,2% das variantes genéticas responsáveis por condições clinicamente importantes no estudo. “O teste teve um desempenho excelente na detecção de todas as variantes clinicamente relevantes encontradas pelo sequenciamento genômico invasivo que teriam passado despercebidas por todos os testes não invasivos atuais, e genotipou com precisão mais de 97% delas. 

Também houve algumas descobertas inesperadas, como gestações gemelares com tecido anormal e evidências de que algumas mães receberam transplante de medula óssea de um doador masculino, o que confundiu os resultados do NIPT”, diz o Dr. Whelan. “Isso forneceu mais evidências da força da técnica.” Estima-se que o NIFS seja consideravelmente mais barato do que o padrão ouro atual de GS invasivo, uma vez que é amplamente baseado em recursos que já existem e estão amplamente disponíveis em laboratórios de diagnóstico comerciais e não requer um procedimento médico. A técnica usa apenas um número ligeiramente maior de leituras de sequenciamento do que as necessárias para o GS invasivo e pode ser usada em um estágio mais precoce da gravidez do que aquele em que a maioria das anormalidades fetais são detectáveis por imagem. Ao fornecer acesso mais precoce a informações e diagnósticos genéticos, o NIFS pode reduzir os custos gerais, permitindo um gerenciamento mais informado da gravidez. O teste já demonstrou ser preciso em amostras de gestações de até 10 semanas, com a proporção de cfDNA no sangue materno proveniente da placenta (a fração fetal) tão baixa quanto 3%. “Nesses níveis de concentração, ainda observamos uma concordância muito alta com o sequenciamento genômico clínico realizado em DNA obtido por meio de testes invasivos”, afirma o Dr. Whelan. 

Os pesquisadores agora pretendem continuar aprimorando as capacidades do NIFS para identificar variantes genéticas clinicamente relevantes adicionais que não são avaliadas pelo sequenciamento de exoma padrão. Eles também estão expandindo e ampliando seus estudos para permitir a triagem por NIFS para todas as gestações no futuro. “Embora os resultados diagnósticos e o desempenho geral do teste não tenham sido uma surpresa, foi notável que tenhamos conseguido acessar e sequenciar uma parte tão grande do genoma fetal a partir de uma simples coleta de sangue materno durante a gravidez. 

No futuro, há muitas pesquisas interessantes em andamento na área de tratamento pré-natal de doenças genéticas. Juntamente com o NIFS, isso poderá ser transformador, permitindo que um tratamento seja usado em um estágio mais precoce e eficaz. O NIFS também nos permite começar a capturar, meses antes do nascimento, as informações clinicamente relevantes que atualmente são avaliadas pela triagem neonatal, permitindo uma preparação precoce para o manejo pós-natal”, afirma o Dr. Whelan. “Esta é uma mudança de paradigma empolgante e um ponto de inflexão para o diagnóstico pré-natal.”